В настоящее время при таких объемах оперативной памяти и быстродействии дисков FAT32 могут ставить только мазохисты
NTFS журналируемая файловая система, это означает, что каждое действие над файлом производится как транзакция, т.е. при внезапном сбое, зависании, отключении питания самое худшее, что может произойти, это возврат к предыдущему состоянию файловой системы до начала последней транзакции, т. е. не теряются бесследно никакие данные, как это часто происходит в FAT32 и иже с ними. Видел, наверное, у себя в корне диска файлы с расширением *.cnk ? Это фрагменты файлов, которые ОС не может сопоставить ни с одним существующим файлом. Появляются чаще всего, если при файловых операциях происходит отключение питания.